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由此构成的蛋白多糖聚合体曲折盘绕，形成多微孔的筛状结构，称为 分子筛。分子筛只允许小于其微 分子筛孔的物质通过，对大于其微孔的大分子物质、细菌等则具有屏障作用。使基质成为限制细菌等有害物质扩散的防御屏障。溶血性链球菌和癌细胞等能产生透明质酸酶，分解蛋白多糖，破坏基质结构，得以扩散。蛋白多糖聚合体上还结合着许多亲水基团，能结合大量水分子，形成细胞外“储水库”。
分子筛是一种具有立方晶格的硅铝酸盐化合物。分子筛具有均匀的微孔结构，它的孔穴直径大小均匀，这些孔穴能把比其直径小的分子吸附到孔腔的内部，并对极性分子和不饱和分子具有吸附能力，因而能把极性程度不同，饱和程度不同，分子大小不同及沸点不同的分子分离开来，即具有“筛分”分子的作用，故称分子筛。由于分子筛具有吸附能力高，热稳定性强等其它吸附剂所没有的优点，使得分子筛获得广泛的应用。
在生物大分子领域，常见的有bio-rad SEC分子筛预装柱。
美国科学家发现，通过调整温度，能够地控制一种钛硅酸盐材料中的孔洞大小，制造出精密的新型分子筛。 一些晶体材料内部有着大量均匀的微孔，尺寸比孔洞小的分子能够穿过，而大分子不能穿过，因此可以起到分离不同分子的作用，这类材料被称为分子筛。
有水热合成、水热转化和离子交换等法：
① 水热合成法 用于制取纯度较高的产品，以及合成自然界中不存在的分子筛。将含硅化合物（水 分子筛玻璃、硅溶胶等）、含铝化合物（水合氧化铝、铝盐等）、碱（氢氧化钠、氢氧化钾等）和水按适当比例混合，在热压釜中加热一定时间，即析出分子筛晶体。合成过程可用下式表示：
工业生产流程中一般先合成Na-分子筛，如13X型与10X型分子筛的合成。在水热合成过程中添加某些添加剂可以改变终产品的结构，如加入季胺盐可得到ZSM-5型分子筛。
② 水热转化法 在过量碱存在时，使固态铝硅酸盐水热转化成分子筛。所用原料有高岭土、膨润土、硅藻土等，也可用合成的硅铝凝胶颗粒。此法成本低，但产品纯度不及水热合成法。
